２０世纪５０年代，周恩来总理明确提出了要使中科院“成为领导全国提高科学水平、培养新生力量的火车头”。针对２１世纪知识经济时代的战略问题，中科院在１９９７年下半年向中央提交报告，提出了建设面向２１世纪的国家创新体系的思路和新时期中科院的战略选择。１９９８年２月，国家主席江泽民批示同意中科院先走一步，“真正搞出我们自己的创新体系”。根据知识创新工程试点规划，到２０１０年，中科院要培养数十名大科学家、数十名科技管理专家、数百个创新团队、几个国际领先的研究所，大幅度提高创新能力。

　　统计数字显示，从１９９８年至２００３年，中科院研究人员在世界顶级的《自然》和《科学》杂志上发表了１１９篇论文，占中国总数的一半。２００２年，中国发表《国际引文索引》（ＳＣＩ）论文排名前２０位的研究机构全部来自中科院。２００３年，中科院发表的ＳＣＩ论文总数达１２０６０篇，比国际一流综合性研究机构德国马普学会多４１０９篇。

　　拥有固定资产１２７．７亿元人民币的中科院在承担国家重大科研项目、发明专利授权、软件著作权登记等方面大大领先于国内高校和其他研究机构。

　　中科院科研人员在一些世界领先的领域做出了重大创新贡献。中科院曾主持研发了中国第一颗原子弹、导弹、人造卫星。４４个研究所、１０００多名科技人员参与了“神舟”五号载人航天任务，在飞船有效载荷、配套材料与设备、空间环境保障、空间科学研究等方面做了大量工作。以中科院人员为主的研究小组在半年时间内完成了国际人类基因组计划１％测序任务。辽西热河生物群研究的重大成果转化为１９篇《自然》和《科学》杂志上的论文，在国际科学界产生了重要影响。中科院科学家还在国际前沿的纳米新材料制备、治疗性干细胞等领域取得了突破性进展。

　　与此同时，作为国家决策者的重要思想库，中科院学部组织院士为高层提供咨询报告和咨询建议。从１９９８年至２００３年，中科院院士提交了４０篇咨询报告和８０篇咨询建议，涉及遏制艾滋病蔓延、经济发达地区污染治理等重大问题。（完）